Аналитический центр (АЦ) создан в 1997 году на химическом факультете МГУ благодаря усилиям член-корр. РАН, проф. О.А. Шпигуна, являвшегося более 20 лет его бессменным руководителем. В 2019 г. Аналитический центр возглавил декан химического факультета, академик РАН, проф. С.Н. Калмыков, который обеспечил дальнейшее развитие Аналитического центра, в том числе нарастив потенциал за счет включения радиохимических методов в практику Аналитического центра. С февраля 2022 г. руководителем Аналитического центра является ведущий научный сотрудник, д.х.н. А.Д. Смоленков. С 1998 года Аналитический центр начал функционировать как аккредитованная испытательная лаборатория. С момента создания национальной системы аккредитации Аналитический центр аккредитован Росаккредитацией (запись в реестре аккредитованных лиц РОСС.RU.0001.511201), что подтверждает соответствие высоким стандартам к достоверности результатов измерений, требованиям международной системы аккредитации, а также демонстрирует серьезное отношение к вопросам своевременного выполнения мероприятий менеджмента качества и контроля качества.