21 сентября 1954 года в городе Дмитрове Московской области был образован военный госпиталь № 888 с двумя лечебно-диагностическими отделениями терапевтического и хирургического профиля на 110 лечебных коек. В связи с организационными мероприятиями в 1966 году военный госпиталь был переведен на новое место дислокации в город Химки. В том же году были открыты новые отделения: кожно-венерологическое, офтальмологическое, стоматологическое и ряд других лечебно-диагностических отделений на общее количество 350 коек. Госпиталь активно включился в работу по сохранению и укреплению здоровья военнослужащих и гражданского персонала на новом месте расположения.

Руководство Главспецстроя высоко оценило профессионализм, чуткость, заботу врачей и медицинского персонала о находящихся на лечении пациентах, поэтому в 1968 году было принято решение о строительстве девятиэтажного главного корпуса, в 1984 году корпус введен в эксплуатацию, что послужило утверждению госпиталя в качестве одного из крупнейших лечебно-профилактического учреждений военной медицины. В 1987 году открыты новые лечебные отделения–гинекологическое и эндоскопическое, отделение гипербарической оксигенации, а в 1989 году-нейрохирургическое и урологическое отделения.

С 01 января 2003 года госпиталь переведен на открытое наименование ГМУ "Центральный госпиталь".

На основании приказа начальника Федеральной службы специального строительства Российской Федерации ГМУ "Центральный госпиталь" с 01 января 2004 года реорганизован путем присоединения к ГМУ "Медицинский центр при Спецстрое России" с присвоением нового открытого наименования - Центральный военный госпиталь ГМУ "Медицинский центр при Спецстрое России".

В дальнейшем учреждение прошло ряд реорганизационных мероприятий, последнее из которых связано с приказом Министра обороны Российской Федерации от 02 декабря 2013 г. № 859 "О переименовании федерального государственного бюджетного медицинского учреждения "Медицинский центр Министерства обороны Российской Федерации" в федеральное государственное бюджетное учреждение "Лечебно-реабилитационный клинический центр" Министерства обороны Российской Федерации с переименованием Центрального военного госпиталя в филиал № 1 (центральный военный госпиталь) ФГБУ "ЛРКЦ" Минобороны России.

Добросовестный труд и доблестная воинская служба сотрудников госпиталя отмечены высокими наградами Правительства Российской Федерации, Министерства обороны Российской Федерации, руководства Московской области и Спецстроя России, Химкинской городской администрации.

На данный момент госпиталь является многопрофильным медицинским учреждением Минобороны России в котором функционируют более 40 отделений и кабинетов и отдельный реабилитационный центр, что позволяет провести полный цикл лечения от диагностики до реабилитации в одних стенах.