Медицинская служба в органах внутренних дел Московской области была создана в соответствии с приказом МВД РСФСР от 27. 01. 1961 № 33 в составе хозяйственного отдела и была расположена в нескольких кабинетах управления внутренних дел в г. Москве на ул. Белинского, 4. Приказом МВД СССР от 21. 06. 1973 № 310 в составе отдела медицинской службы УВД создана санитарно-эпидемиологическая станция. Медицинский отдел, как структурное подразделение ГУВД, создан приказом ГУВД Мособлисполкома от 20. 03. 1978 № 25. В то время медицинскому отделу были непосредственно подчинены: окружная военно-врачебная комиссия (созданная приказом ГУВД Мособлисполкома от 05. 03. 1970 № 16), санитарно-эпидемиологическая станция, здравпункты при УВД-ОВД Московской области. Функционально медицинскому отделу были подчинены медицинские части следственных изоляторов, исправительно-трудовых колоний, домов ребенка, медицинский персонал медвытрезвителей и изоляторов временного содержания. В 1987 году приказом ГУВД от 18. 07. 1987 № 15 в составе военно-врачебной комиссии была создана психофизиологическая лаборатория. Приказом ГУВД от 20. 02. 1995 № 33 она была выведена из состава ВВК и реорганизована в Центр психодиагностики.

В 1985 году сдано в эксплуатацию 8-этажное здание поликлиники ГУВД Московской области по адресу: Москва, ул. Новая Ипатовка, 3 и начато ее функционирование. В поликлинике имеется 20 лечебно-диагностических отделений и кабинетов, при У(О)МВД России по Московской области функционируют 40 врачебно-фельдшерских здравпунктов. Медицинская помощь оказывается в поликлинике по 28 специальностям (акушерство-гинекология, гастроэнтерология, дерматовенерология, инфекционные болезни, кардиология, клиническая лабораторная диагностика, колопроктология, лечебная физкультура, неврология, онкология, оториноларингология, офтальмология, психиатрия, пульмонология, ревматология, рентгенология, терапия, травматология и ортопедия, физиотерапия, функциональная диагностика, хирургия, эндоскопия, эндокринология, стоматология терапевтическая, стоматология ортопедическая, стоматология хирургическая, ультразвуковая диагностика, урология).

В 2005 году Управлением медико-социальной защиты Департамента Тыла МВД России предложено создать аптеку при Медико-санитарной части (МСЧ).

В 1997 году приказом ГУВД Московской области от 26. 06. 1997 № 132 на базе медицинского отдела создается медицинское управление ГУВД Московской области.

В 1997-1998 гг. в системе медицинской службы начало свое развитие такое направление медицинской помощи, как организация медицинской помощи в чрезвычайных ситуациях и при аварийно-спасательных работах. В системе медицинской службы было создано отделение, а затем и отдел данного направления деятельности.

В 2005 году на базе медицинских учреждений ГУВД Московской области распоряжением Правительства Российской Федерации от 16. 07. 2005 № 1018-р создано федеральное государственное учреждение здравоохранения "Медико-санитарная часть ГУВД Московской области". В его состав вошли Поликлиника, Военно-врачебная комиссия, Центр психофизиологической диагностики, Центр государственного санитарно-эпидемиологического надзора, медицинские части № 1 (по обслуживанию Всероссийского института повышения квалификации сотрудников МВД России) и № 2 (по обслуживанию Московского областного филиала Московского университета МВД России).

Собственной стационарной базы МСЧ на данный момент не имеет.

19. 04. 2006 МСЧ зарегистрирована как юридическое лицо за основным государственным регистрационным номером. В настоящее время МСЧ имеет следующие лицензии: на осуществление медицинской деятельности, выданную Территориальным органом Росздравнадзора по г. Москве и Московской области 14. 05. 2015 № ФС-77-01-001049; на осуществление фармацевтической деятельности, выданную Территориальным органом Росздравнадзора по г. Москве и Московской области 25. 06. 2015 № ФС-77-02-000838; на осуществление деятельности по обороту наркотических средств, психотропных веществ и их прекурсоров, культивированию наркосодержащих растений, выданную Территориальным органом Росздравнадзора по г. Москве и Московской области 05. 12. 2014 № ФС-77-03-000063; на проведение работ, связанных с использованием сведений, составляющих государственную тайну, выданную УФСБ России по г. Москве и Московской области 30. 12. 2014 серия ГТ № 0079530.

В рамках развития стационарзамещающих технологий в медицинских организациях МВД России приказом МСЧ от 26. 11. 2015 № 90 в составе поликлиники МСЧ образован дневной стационар на 8 коек по профилям: терапия, неврология и хирургия.

В 2015 году МСЧ организована работа медицинского кабинета по обслуживанию Оперативного Управления ГУ МВД России по Московской области. В 2016 году МСЧ организована работа медицинского кабинета в здании отдела полиции по обслуживанию мкр. Железнодорожный и медицинского кабинета по обслуживанию ОМВД России по Рузскому району.